بررسی چند شکلی dna در جمعیت های ag-۴ rhizoctonia solani با استفاده از نشانگر مولکولی rdna rflp

توالی­های dna ریبوزومی به­دلیل اینکه دارای کپی­های زیادی از ژن­های rrna و نیز درجه بالایی از تغییر می­باشند، به­منظور بررسی روابط فیلوژنی در محدوده وسیعی از سطوح تاکسونومی مورد استفاده قرار می­گیرند. نواحی its و فواصل داخل ژنی dna ریبوزومی هسته­ای، واحد­های تکراری تکامل یافته ثابت می­باشند و ممکن است در بین گونه های داخل یک جنس یا در بین افراد یک جمعیت متغیر باشند. به­منظور ارزیابی چند شکلی نواحی حد فاصل ژن­های s28 و s18 در ژنوم قارچ rhizoctonia solani  گروه آناستوموزی 4 (ag-4)، 28جدایه از میزبان­های مختلف مورد ارزیابی قرار گرفتند. از جدایه­ها dna استخراج و از آن­ها به عنوان الگو در واکنش­های pcr استفاده شد. در تکثیر نواحی فاصله­ساز داخلی بین ژن­های ریبوزومی با استفاده از آغازگر­های its1 و its4 یک قطعه dna به اندازه 700 جفت باز ردیابی شد. قطعه مذکور با آنزیم­های برشیtaq i  xba i, hae iii, bam hi, hind iii, sac i, pst i, nde i, xho i, hinc ii, hinf i, eco ri, هضم شد. ولی آنزیم­های xba i, bam hi, hind iii, sac i, pst i, nde i, xho i فاقد محل برش بودند. نتایج حاصله نشان داد که جدایه­های rhizoctonia solani ag4 هتروژن بوده و its-rflp با استفاده از آنزیم hinc ii تفاوت بین زیرگروه­های ag4-hg i و ag4-hg ii رااز نظر الگوی برش آنزیمی نشان داد.